Die Ursachen für Chorea Huntington sind genetischer Natur. Die Krankheit wird durch eine Mutation im sogenannten HTT-Gen verursacht, das für die Produktion des Huntingtin-Proteins verantwortlich ist. Bei Menschen mit Chorea Huntington liegt eine Verlängerung des CAG-Trinukleotid-Repeats im HTT-Gen vor. Je größer die Anzahl der CAG-Wiederholungen ist, desto früher tritt die Krankheit in der Regel auf und desto schwerwiegender sind die Symptome.
Die Vererbung der Krankheit erfolgt autosomal dominant, was bedeutet, dass ein betroffenes Elternteil das mutierte Gen mit einer Wahrscheinlichkeit von 50% an seine Kinder weitergeben kann. Es besteht jedoch auch die Möglichkeit, dass die Krankheit spontan auftritt, ohne dass eine familiäre Vorgeschichte vorliegt.
Die genauen Mechanismen, wie die Mutation im HTT-Gen zu den Symptomen von Chorea Huntington führt, sind noch nicht vollständig verstanden. Es wird angenommen, dass das mutierte Huntingtin-Protein im Gehirn toxische Wirkungen hat und zu einer Schädigung der Nervenzellen führt.