CDKL5-to genetyczne mutacje de Novo- (losowych spontanicznych mutacji) sensu w tym nie ma (zazwyczaj) jest przekazywana z rodzica na dziecko - to się czasem zdarza w czasie rozwoju płodowego/poczęcia, ale naukowcy nie byli w stanie określić dokładny czas mutacji dzieje.
W bardzo rzadkich przypadkach może być spowodowany Germain mosacism - czyli na rodziców komórka jajowa lub plemnik, ale nie w nadrzędnym się po prostu w skład genetyczny plemnika lub komórki jajowej