As causas das Distrofias Cone-rod são geralmente genéticas, ou seja, são causadas por mutações nos genes responsáveis pela função dos cones e bastonetes na retina. Essas mutações podem ser herdadas dos pais ou ocorrerem de forma espontânea durante o desenvolvimento do embrião.
Existem diferentes genes envolvidos nas Distrofias Cone-rod, como o gene ABCA4, que está associado à degeneração macular relacionada à idade, e o gene RPGR, que está relacionado à retinite pigmentosa. Essas mutações afetam a produção ou a função das proteínas necessárias para o funcionamento adequado dos cones e bastonetes, levando à degeneração progressiva dessas células.
Além das causas genéticas, fatores ambientais e outros genes podem influenciar no desenvolvimento e na progressão das Distrofias Cone-rod. No entanto, mais pesquisas são necessárias para compreender completamente todas as causas envolvidas nessa condição.