Orsakerna till Aspergers syndrom är ännu inte helt klara, men det antas vara en kombination av genetiska och miljömässiga faktorer. Genetiska faktorer spelar en betydande roll, då personer med en familjehistoria av autism eller Aspergers syndrom har en ökad risk att utveckla tillståndet. Forskning har identifierat vissa gener som kan vara kopplade till syndromet, men det är inte enbart ärftligt.
Det finns också miljömässiga faktorer som kan påverka utvecklingen av Aspergers syndrom. Exponering för vissa kemikalier under graviditeten, för tidig födsel eller komplikationer under födseln kan öka risken. Det har också föreslagits att rubbningar i hjärnans utveckling och kommunikationssystem kan spela en roll.
Det är viktigt att notera att Aspergers syndrom inte är en följd av dålig uppfostran eller bristande kärlek från föräldrarna. Det är en neurologisk variation som påverkar hur hjärnan bearbetar information och interagerar med omvärlden.