L'espérance de vie des personnes souffrant de la Granulomatose de Wegener a amélioré de façon très significative au cours des dernières décennies. Avant la décennie des années 70 de la moitié des patients est mort 6 mois après le diagnostic. En 2017, plus de 80% des patients qui suivent un traitement approprié de vivre au-delà de 8 ans. Plus de la moitié des patients qui reçoivent un traitement de rémission et de l'espérance de vie est bonne. Ceux qui ont des récidives, et de ne pas entrer en rémission ont de plus mauvais pronostic, et une espérance de vie plus faible que la population générale. Cependant, les nouveaux traitements, tels que le cyclophosphamide et rituximab sont en nette amélioration de la survie des statistiques de gens avec de la Granulomatose de Wegener.