PHP può svilupparsi entro la settimana 4-8 gamma di in utero. La linea mediana è di solito interessato, che non provoca o piccola ghiandola pituitaria. PHP può anche accadere più tardi nella vita, soprattutto da tumore o vicino alla ghiandola pituitaria nel cervello. Non so la causa per l'ambiente, infezioni, farmaci, o con la dieta è stata confermata. Genetica sono in discussione, ma nessun feedback positivo è stato confermato.