A esperança de vida com a Doença de Creutzfeldt-Jakob é muito reduzida. Aproximadamente 90-95% dos pacientes morrem dentro de um ano após o diagnóstico. Apenas um percentual muito baixo de pessoas com a doença sobreviveu por mais de dois anos. As maiores complicações se devem à deterioração mental, devido à acumulação de pequenos patogênicos infecciosos que, finalmente, levam o paciente ao coma. Apesar de este prognóstico, são muitas as pesquisas que se realizam para dar uma maior esperança para o futuro.