O PHP pode desenvolver dentro de 4 a 8 semanas de intervalo no útero. A linha média é geralmente afetado, o que faz com que nenhuma ou pequena glândula pituitária. O PHP também pode acontecer mais tarde na vida, principalmente por tumor ou perto de glândula pituitária no cérebro. Não sabe o motivo pelo ambiente, infecções, medicamentos, ou dietético foi confirmado. A genética está sendo questionada, mas nenhum feedback positivo foi confirmado.