Cerca de 25% dos indivíduos com situs inversus tem subjacente uma condição conhecida como discinesia ciliar primária (PCD). . PCD é uma disfunção dos cílios, que se manifesta durante a embryologic fase de desenvolvimento. Normalmente funcionamento cílios determinar a posição dos órgãos internos durante o começo do desenvolvimento embrionário, e assim embriões com PCD têm 50% de chance de desenvolver situs inversus.