Rekommenderade behandlingar för Crohns sjukdom och Ulcerös Kolit kan variera beroende på engagemang av varje patient. Även om nya droger som är nya, protokoll att följa är mycket som föreskrivs. Patienten tenderar att ha en underhållsbehandling, utom i de fall där det inte är nödvändigt, som vanligtvis består i att ta av immunsuppressiva och/eller biologiska behandlingar. Denna behandling syftar till att hålla patienten i remission och kontrollera symtomen. Perioder av utbrott är vanligen kontrolleras med höga doser av kortikosteroider. I de flesta akuta fall, är det nödvändigt att ta till kirurgi.
Dagens behandlingar ger mycket bra resultat, och även om varje person reagerar olika på dem, majoriteten av de drabbade klarar av att avsevärt förbättra din livskvalitet.