Diagnosen av histoplasmos kan göras genom olika metoder. En vanlig metod är att undersöka patientens blod eller vävnadsprover för att upptäcka förekomsten av antikroppar mot Histoplasma-svampen. Detta kan göras genom att utföra en serologisk testning som mäter nivåerna av antikroppar i blodet.
En annan viktig metod är att använda mikroskopisk undersökning av prov från patientens lungor, sputum eller andra misstänkta infektionsområden. Genom att färga provet med specifika färgämnen kan man identifiera svampens karakteristiska strukturer.
Vidare kan odling av svampen utföras genom att placera provet på speciella odlingsmedier som främjar tillväxten av Histoplasma-svampen. Detta kan ta några veckor innan resultatet blir tillgängligt.
Slutligen kan molekylär diagnostik användas för att detektera svampens DNA i patientens prov. Denna metod är snabb och känslig, men kräver specialutrustning och expertis.