Behandling av Lemierre syndrom är en hög dos parenteral antibiotika riktad mot anaerobes (klindamycin, metronidazol, kloramfenikol, imipenem, eller cefodizime). Långvarig behandling rekommenderas på grund av det endovaskulära typ av infektion. Ligering eller excision av den inre halsvenen är ofta det behövs, och dränering av andra abscesser kan vara nödvändigt.