No existe ningún tipo de medicación diseñada específicamente para tratar la Cefalea en Racimos. Existe medicación que puede aliviar algo los síntomas, pero son insuficientes y suelen dejar de funcionar al poco tiempo. Toda esta medicación tiene demasiados efectos secundarios serios.
El tratamiento que mejor funciona y más usado, para minimizar los síntomas durante un ciclo es el Verapamilo.
Como tratamiento puente son eficaces los corticoides y los bloqueos GONB.