En algunas personas la trombocitopenia es causada por el sistema inmunitario ataca por error y destruye las plaquetas. Si la causa de esta reacción inmune es desconocido, la condición se conoce como la púrpura trombocitopénica idiopática. Idiopática significa "de causa desconocida."
En la mayoría de los niños con PTI, el trastorno de la siguiente manera una enfermedad viral, como las paperas o la gripe. Puede ser que la infección provoca el mal funcionamiento del sistema inmunológico.