La esperanza de vida de una persona con Mastocitosis es muy variable y depende del tipo y la gravedad de los síntomas, aunque la mayoría de los pacientes desarrolla un pronóstico favorable.
La mastocitosis cutánea generalmente no altera las expectativas de vida de la persona afectada; sin embargo, en su forma más agresiva, esta enfermedad puede provocar leucemia crónica u otras condiciones graves en la sangre, que acortan la esperanza de vida del paciente.
Algunos tipos de la enfermedad (como la leucemia de mastocitos) son más agresivos. En este tipo la médula ósea y otros órganos como el intestino, el hígado o el bazo, están infiltrados por los mastocitos.