La esperanza de vida con Síndrome de Moebius es similar a la de la población general, sobre todo en pacientes que no se ven afectados por complicaciones graves en su primer año de vida.
A pesar de que no existe cura para el Síndrome de Moebius, una persona diagnosticada puede aprender a vivir con la enfermedad y llevar una vida normal, plena y significativa.
Las terapias físicas y del lenguaje pueden ayudar a mejorar los problemas del habla y de expresión facial. En muchos casos los especialistas recomiendan la cirugía para corregir los ojos cruzados y mejorar las deformidades de las extremidades.